Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMB1P20618 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms