Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PVALBP20472 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PVALBP20472 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PVALBP20472 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PVALBP20472 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PVALBP20472 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PVALBP20472 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PVALBP20472 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PVALBP20472 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PVALBP20472 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PVALBP20472 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PVALBP20472 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PVALBP20472 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PVALBP20472 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PVALBP20472 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PVALBP20472 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PVALBP20472 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PVALBP20472 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PVALBP20472 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms