Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TNNI3P19429 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TNNI3P19429 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TNNI3P19429 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TNNI3P19429 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms