Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXB4P17483 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms