Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MS4A1P11836 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms