Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GPR89BP0CG08 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms