Protein–RNA interactions for Protein: P08195

SLC3A2, 4F2 cell-surface antigen heavy chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A2P08195 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC3A2P08195 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms