Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBX7O95931 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CBX7O95931 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBX7O95931 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CBX7O95931 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CBX7O95931 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CBX7O95931 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms