Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DDX58O95786 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDX58O95786 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDX58O95786 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDX58O95786 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX58O95786 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX58O95786 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX58O95786 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX58O95786 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX58O95786 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DDX58O95786 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX58O95786 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX58O95786 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX58O95786 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX58O95786 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX58O95786 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDX58O95786 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDX58O95786 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms