Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX4O95219 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX4O95219 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX4O95219 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX4O95219 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms