Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FARP2O94887 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FARP2O94887 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FARP2O94887 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP2O94887 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP2O94887 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP2O94887 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP2O94887 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP2O94887 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP2O94887 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP2O94887 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP2O94887 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FARP2O94887 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FARP2O94887 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FARP2O94887 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FARP2O94887 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FARP2O94887 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms