Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CDKL5O76039 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CDKL5O76039 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms