Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG13O75143 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG13O75143 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG13O75143 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG13O75143 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG13O75143 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG13O75143 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG13O75143 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG13O75143 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG13O75143 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG13O75143 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG13O75143 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG13O75143 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG13O75143 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG13O75143 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG13O75143 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG13O75143 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG13O75143 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG13O75143 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG13O75143 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG13O75143 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG13O75143 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG13O75143 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms