Protein–RNA interactions for Protein: O75128

COBL, Protein cordon-bleu, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLO75128 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COBLO75128 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
COBLO75128 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COBLO75128 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLO75128 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLO75128 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLO75128 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLO75128 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLO75128 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLO75128 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLO75128 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLO75128 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLO75128 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COBLO75128 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COBLO75128 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COBLO75128 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLO75128 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLO75128 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLO75128 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLO75128 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLO75128 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLO75128 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLO75128 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLO75128 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COBLO75128 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms