Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EIF5BO60841 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF5BO60841 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms