Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
MARCH6O60337 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH6O60337 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms