Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CBFA2T2O43439 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms