Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PLXNB1O43157 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms