Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF646O15015 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF646O15015 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms