Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP2A1O14983 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms