Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC27A2O14975 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC27A2O14975 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms