Protein–RNA interactions for Protein: O00712

NFIB, Nuclear factor 1 B-type, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIBO00712 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIBO00712 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIBO00712 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIBO00712 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIBO00712 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFIBO00712 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIBO00712 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIBO00712 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIBO00712 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIBO00712 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIBO00712 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIBO00712 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIBO00712 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIBO00712 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIBO00712 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIBO00712 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIBO00712 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIBO00712 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIBO00712 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIBO00712 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIBO00712 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIBO00712 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIBO00712 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIBO00712 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIBO00712 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIBO00712 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIBO00712 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIBO00712 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIBO00712 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIBO00712 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIBO00712 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIBO00712 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIBO00712 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIBO00712 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIBO00712 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIBO00712 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIBO00712 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIBO00712 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIBO00712 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NFIBO00712 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NFIBO00712 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms