Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PODXLO00592 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PODXLO00592 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PODXLO00592 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PODXLO00592 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PODXLO00592 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PODXLO00592 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PODXLO00592 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PODXLO00592 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PODXLO00592 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PODXLO00592 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
PODXLO00592 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PODXLO00592 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PODXLO00592 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms