Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
POLRMTO00411 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms