Protein–RNA interactions for Protein: E5RIL1

UPK3BL2, Uroplakin-3b-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL2E5RIL1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UPK3BL2E5RIL1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms