Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMEM229AB2RXF0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms