Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HACD1B0YJ81 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HACD1B0YJ81 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms