Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOBPA7XYQ1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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