Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU8

PGPEP1L, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1LA6NFU8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PGPEP1LA6NFU8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms