Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC004801.6-201ENST00000616571 978 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 MLF1-205ENST00000469452 1098 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
CTNNA3Q9UI47 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms