Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ARR3-202ENST00000374495 1298 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LY6G6E-225ENST00000383418 383 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MIR185-201ENST00000385288 82 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC01644-201ENST00000405369 984 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC009228.1-201ENST00000413254 240 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MTND6P11-201ENST00000431890 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 FTH1P7-201ENST00000450676 552 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL391422.2-202ENST00000454396 347 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC139451.1-201ENST00000463176 330 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPSAP48-201ENST00000466509 889 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 NME9-208ENST00000484930 825 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RPS10P5-201ENST00000492704 531 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC112192.1-201ENST00000515086 553 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ACTBP6-201ENST00000520036 1090 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC138356.2-201ENST00000521192 667 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC4-206ENST00000525303 654 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SSR2-215ENST00000529008 849 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RRP8-205ENST00000534343 726 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC005832.4-201ENST00000536588 818 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC007406.2-201ENST00000540868 503 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC025030.1-201ENST00000548007 573 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC089998.4-201ENST00000552532 459 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC087190.3-201ENST00000562893 753 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC145350.2-202ENST00000564165 685 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC092139.1-201ENST00000567149 497 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC005954.2-201ENST00000586503 556 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SLC14A1-214ENST00000589700 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SDCBP2-AS1-202ENST00000607947 808 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RNVU1-19-201ENST00000613023 167 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HOXA11-AS1_2.1-201ENST00000615604 187 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 HLA-B-258ENST00000640615 240 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL132780.5-201ENST00000623843 1625 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CDY15P-201ENST00000421995 1570 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CDY22P-201ENST00000451423 1554 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms