Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 ARMC4P1-201ENST00000438905 707 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 GAPDHP41-201ENST00000613707 975 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 UBQLN1P1-207ENST00000441056 1169 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC136489.1-203ENST00000450246 736 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC016405.1-202ENST00000524348 758 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 PLN-201ENST00000357525 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
SYCP1Q15431 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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