Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CACNA1SQ13698 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 GABRQ-201ENST00000598523 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 PROX1-201ENST00000261454 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CACNA1SQ13698 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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