Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ITGB3BPQ13352 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms