Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 YWHAZP4-201ENST00000392459 708 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC095033.1-201ENST00000451611 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC007207.2-201ENST00000543206 542 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 Metazoa_SRP.81-201ENST00000618466 316 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 CAV1-203ENST00000393468 845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 SLC8A1-AS1-202ENST00000417875 344 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 ANAPC10-213ENST00000512680 505 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC025809.1-201ENST00000585336 560 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC010326.3-201ENST00000597780 679 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NPRL3Q12980 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms