Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ADA2-201ENST00000262607 3925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RALBP1-206ENST00000609094 3676 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 GC-201ENST00000273951 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 UMAD1-206ENST00000636849 2157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC245047.5-201ENST00000437312 556 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 BUB1P1-201ENST00000603541 607 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC011591.1-201ENST00000591379 518 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 TRMT10A-202ENST00000394876 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 LINC02547-201ENST00000531559 3308 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPN13Q12923 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
PTPN13Q12923 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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