Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
HOXD13P35453 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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HOXD13P35453 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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HOXD13P35453 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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HOXD13P35453 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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HOXD13P35453 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
HOXD13P35453 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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