Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AP005639.1-201ENST00000526939 192 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC004034.1-201ENST00000573260 510 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC119674.1-213ENST00000641177 1386 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 MAPK10-287ENST00000641217 3037 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
ZBED1O96006 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms