Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ACTBP1-201ENST00000417985 1113 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RBMY2KP-201ENST00000418221 992 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC006455.4-201ENST00000418297 528 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FAM236D-201ENST00000419795 433 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL139246.3-201ENST00000424215 626 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RNF11P2-201ENST00000427702 440 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL133553.1-201ENST00000428391 353 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC074351.1-201ENST00000439413 481 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC245060.1-201ENST00000440829 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC073188.4-201ENST00000450077 528 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 EZR-AS1-201ENST00000451712 217 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CTSLP4-201ENST00000454614 1002 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CXCR6-203ENST00000457814 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 FAM236D-202ENST00000458170 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RN7SL74P-201ENST00000464966 299 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC117395.3-201ENST00000471176 680 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AL442663.1-201ENST00000478589 364 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 TRIM2-207ENST00000482578 773 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RN7SL241P-201ENST00000482973 236 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 C21orf62-203ENST00000487113 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 PRR7-AS1-203ENST00000511565 502 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 LINC01095-203ENST00000512063 1175 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 STX18-IT1-201ENST00000515487 542 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP278-201ENST00000517055 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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ANKRD39Q53RE8 AC021678.2-201ENST00000521731 887 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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ANKRD39Q53RE8 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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ANKRD39Q53RE8 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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ANKRD39Q53RE8 CARS-216ENST00000639317 135 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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ANKRD39Q53RE8 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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ANKRD39Q53RE8 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ANKRD39Q53RE8 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MITF-206ENST00000394351 1956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 TMEM192-201ENST00000306480 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 IL17F-201ENST00000336123 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SH2D1A-201ENST00000360027 593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ANKRD39Q53RE8 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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