Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 TOMM6-202ENST00000398884 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 IGKV1OR2-3-201ENST00000411475 288 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL391811.1-201ENST00000416908 423 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 GLRXP3-201ENST00000470810 321 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 IGKV2D-38-201ENST00000518423 240 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 OR7E154P-201ENST00000525174 932 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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GRIK4Q16099 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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GRIK4Q16099 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
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GRIK4Q16099 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SPATA31A1-201ENST00000377647 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SPATA31A7-206ENST00000619167 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ASB8-201ENST00000317697 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 RTL3-201ENST00000321110 2648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PEX19-201ENST00000368072 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 VTI1A-202ENST00000432306 1738 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ADGRB3-201ENST00000238918 2927 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 IARS-206ENST00000447699 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SEMA5A-AS1-201ENST00000510879 1679 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 TRBV6-7-201ENST00000390373 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
GRIK4Q16099 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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