Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 HMGA1P8-201ENST00000414130 321 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CYTH1Q15438 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CYTH1Q15438 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CYTH1Q15438 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CYTH1Q15438 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CYTH1Q15438 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CYTH1Q15438 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CYTH1Q15438 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CYTH1Q15438 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CYTH1Q15438 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CYTH1Q15438 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CYTH1Q15438 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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