Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AMD1-203ENST00000368882 3059 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 DTNA-225ENST00000595022 6016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 FOXJ3-203ENST00000372571 4468 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 SYTL5-202ENST00000456733 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 HMCN2-206ENST00000624552 15610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CHD4Q14839 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms