Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
RFTN1Q14699 CRB1-211ENST00000638467 4348 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AMN1-208ENST00000537562 1538 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL136455.1-201ENST00000441083 1240 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
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RFTN1Q14699 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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RFTN1Q14699 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC110056.1-201ENST00000525759 911 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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RFTN1Q14699 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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RFTN1Q14699 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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RFTN1Q14699 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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RFTN1Q14699 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
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RFTN1Q14699 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
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RFTN1Q14699 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 OR8U1-201ENST00000302270 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL356476.1-201ENST00000421481 480 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
RFTN1Q14699 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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