Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC112243.1-201ENST00000623949 3851 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ADAL-203ENST00000428046 3514 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC022905.1-201ENST00000503430 3048 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 GSTM2-205ENST00000414179 982 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LINC02451-201ENST00000546982 565 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 BCORP1-202ENST00000441139 3461 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SYT14-207ENST00000629778 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
SRSF5Q13243 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
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