Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 OR7A18P-201ENST00000600416 277 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC009502.1-202ENST00000606673 602 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC131159.2-201ENST00000613236 702 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 TEX41-279ENST00000629149 609 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 NXPE3-207ENST00000616286 1832 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC117382.2-201ENST00000564748 3151 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SUN1-219ENST00000452783 3717 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 KLHL8-202ENST00000425278 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ESRP1-203ENST00000433389 3770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 TRIM49D1-202ENST00000530311 2164 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 PIGN-251ENST00000640876 6045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 GLULP5-201ENST00000547831 1390 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 YME1L1-203ENST00000376016 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AEBP2-202ENST00000360995 2533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SPATA31D5P-201ENST00000376459 4784 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 KIZ-AS1-203ENST00000616177 5370 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ANO2-201ENST00000327087 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 PCDH15-224ENST00000612394 5765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AJUBA-203ENST00000397388 2648 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 UTRN-203ENST00000367526 3220 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SWT1-202ENST00000367501 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SORL1-211ENST00000532694 3692 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 KEL-201ENST00000355265 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LINC00284-202ENST00000439707 2521 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 HNRNPCL4-201ENST00000323770 882 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 HBS1L-202ENST00000367820 638 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SERPINB12-202ENST00000382768 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RPS7-204ENST00000407445 833 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LINC00426-202ENST00000417079 1045 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC019181.1-201ENST00000417151 310 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL583805.2-201ENST00000418571 486 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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MKRN3Q13064 AL049758.1-201ENST00000423154 397 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MIATNB-204ENST00000437071 1006 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CR391992.1-201ENST00000438601 394 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC004593.1-201ENST00000446246 798 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL355483.3-201ENST00000446686 752 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LINC01007-203ENST00000451953 579 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC069213.3-201ENST00000454858 474 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RPSAP52-201ENST00000489520 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC126755.2-209ENST00000531453 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC138969.1-212ENST00000541593 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 NPIPA5-203ENST00000543801 699 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC022558.2-201ENST00000566841 754 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC060766.2-201ENST00000588235 334 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AP001017.1-201ENST00000591378 482 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL008726.1-201ENST00000607703 569 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MIR7150-201ENST00000614393 94 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AL139811.2-201ENST00000373465 1630 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SELENON-205ENST00000630065 2994 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC009021.2-201ENST00000567401 1666 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 AC008543.1-201ENST00000344893 3383 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ANO2-202ENST00000356134 3717 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 PTPRB-201ENST00000261266 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SH3D19-202ENST00000409252 4888 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 PTPRT-205ENST00000373193 12681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MORF4L2-210ENST00000451301 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 RBFOX1-223ENST00000620507 4018 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 GNE-205ENST00000539815 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ZNF702P-201ENST00000270443 2990 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CDRT1-203ENST00000395667 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 TRPM1-202ENST00000397795 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 MTMR2-204ENST00000409459 3420 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ZNF385D-201ENST00000281523 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 SLC17A3-203ENST00000361703 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 LGSN-201ENST00000370657 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 ITSN2-202ENST00000361999 5814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
MKRN3Q13064 TANC2-201ENST00000389520 6404 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
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