Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
NESP48681 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NESP48681 AC124017.1-201ENST00000508112 1594 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NESP48681 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NESP48681 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NESP48681 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NESP48681 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NESP48681 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
NESP48681 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NESP48681 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
NESP48681 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 F5-201ENST00000367796 7039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 ZNF385D-AS1-201ENST00000412369 705 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 CAND1-208ENST00000545606 11251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
NESP48681 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 FREM1-202ENST00000380880 7324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
NESP48681 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 VTI1A-201ENST00000393077 4131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 CLASP1-215ENST00000541377 7909 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 TEX38-202ENST00000415500 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
NESP48681 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NESP48681 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NESP48681 CAPRIN1-209ENST00000530820 3454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NESP48681 LRP1-201ENST00000243077 14897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NESP48681 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NESP48681 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NESP48681 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
NESP48681 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
NESP48681 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms