Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 TGIF1-211ENST00000548489 1536 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL355306.2-201ENST00000635570 1542 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC079949.2-201ENST00000617117 2933 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SP110-201ENST00000258381 2426 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL049697.3-201ENST00000406493 982 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC007179.2-206ENST00000434611 467 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
HOXD12P35452 CXCR2P1-202ENST00000443392 1074 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms