Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 NAPEPLD-203ENST00000417955 4988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC009831.5-201ENST00000624000 3189 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
ERVV-1B6SEH8 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC022819.1-201ENST00000563495 3910 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AL353626.3-201ENST00000413399 657 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 AC004836.1-201ENST00000623032 634 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
ERVV-1B6SEH8 MELK-211ENST00000545008 2236 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms