Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AL121985.1-201ENST00000598917 1308 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 CEACAM1-213ENST00000599389 1342 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC114956.3-202ENST00000505645 482 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC234917.1-201ENST00000534006 316 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AL358292.1-201ENST00000554181 412 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR4258-201ENST00000580920 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AF186192.2-204ENST00000581667 524 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099777.1-201ENST00000603779 1070 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC244517.6-202ENST00000623884 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ARL2-SNX15V9GYD0 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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