Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CTNNA3Q9UI47 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CTNNA3Q9UI47 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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CTNNA3Q9UI47 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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CTNNA3Q9UI47 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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CTNNA3Q9UI47 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CTNNA3Q9UI47 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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